一、建设情形
为顺应人类基因组特殊是重大疾病基因组研究生长需求,研究所于2010年酝酿形成“重大疾病基因组和个体化医疗”所级重点实验室。实验室从基因组变异,特殊是肿瘤基因组的突变谱系研究入手,团结高通量基因组序列和数据剖析,推动开展从基因组到表观组学的系统研究,为实现个体化医疗涤讪基础。
随着基因组手艺生长和临床研究要求,特殊是高通量测序的普遍使用,个体化医疗(医学)的看法已经演化为基于组学数据和多条理知识网络的“精准医学”。实验室进一步将基因组变异与表观遗传修饰的研究相团结,生长为瞄准精准医学的研究团队。“九游会j9精准基因组医学重点实验室”通过院评审,于2014年8月21日获准正式建设。
二、定位
针对我院生齿康健和普惠康健系统建设的重大科研偏向,驻足肿瘤基因组和重大疾病的基因组学研究,以肿瘤细胞突变的群体基因组学立异研究思绪为主要切入点,施展在表观基因组学方面的研究优势,立异基因组剖析手艺和高通量基因组数据盘算要领,在肿瘤等重大疾病基因组相关的重大科学问题研究中一直取得立异突破。
三、研究偏向
1.肿瘤异质性及检测治疗新要领
在前期用群体遗传和进化理论举行肿瘤突变剖析获得癌症突变谱系特征和要领学的多种突破的基础上,探讨肿瘤的体细胞突变纪律和关于肿瘤基因表达的影响,掘客新的肿瘤检测与干预步伐。学术带动人王前飞。
2.发育、朽迈和疾病的基因组与表观基因组特征
在前期DNA甲基化、RNA甲基化、非编码RNA及组卵白修饰的表观基因组、表观转录组和表观卵白组的系统研究基础上,开展纵深的疾病表观组学研究,发明疾病的表观组学标记物,研发响应表观组学手艺和疾病的体液无创检测。学术带动人杨运桂。
3.大数据剖析运算和精准医学范式建设
依托所、院软硬件优势,针对前瞻性行列和临床样本的基因组和表型数据举行大规模剖析和多条理数据整合,建设基因组康健档案和开展多方面康健相关预警研究,形成整合已有知识和研究效果的精准医学知识库,通过院地相助建设精准医学基地和推广研究范式。学术带动人曾长青、陈华。
4.重大心理性状功效注释与个体化特征模式
人类基因组学研究的最终目的就是在精准注释所有人群的基因和基因组水平因子在种种心理和病理性状中的基础上,抵达关于个体的康健维护和关于疾病的展望、预警和准确干预。团队将继续和整合前期在这一偏向的优势项目,针对基因组稳固性转变关于肿瘤爆发和耐药性爆发的作用机制、低氧顺应相关基因及其多态性在高原顺应和肿瘤微情形中的功效作用、人体形态和心理性状的基因组基础等举行深入功效注释研究,获得其个体化的特征和模式。学术带动人郭彩霞、刘凡。
四、机构组成
实验室实验研究所向导、学术委员会指导下的主任责任制:
实验室主任:曾长青研究员
实验室副主任:杨运桂研究员 王前飞研究员
学术委员会:
主任:沈岩院士,中国医学科学院基础医学研究所
副主任:曾益新院士,中国医学科学院北京协和医学院
委员:(按姓氏拼音排序)
陈润生院士,九游会j9生物物理研究所
季加孚教授,北京大学临床肿瘤学院
李林院士,九游会j9上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所
林东昕院士,中国医学科学院肿瘤医院
时玉舫研究员,九游会j9上海生命科学研究院/上海交通大学医学院康健科学研究所
王前飞研究员,九游会j9
王小宁教授,中国人民解放军总医院
吴虹教授,北京大学
徐国良院士,九游会j9上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所
徐涛研究员,九游会j9生物物理研究所
杨运桂研究员,九游会j9
曾长青研究员,九游会j9
张学敏院士,军事医学科学院
周琪院士,九游会j9动物研究所
五、年度主要科研希望
1.肿瘤治疗及检测新要领
与苏州大学隶属儿童医院血液科相助,首次在儿童急性髓系白血病中使用十分之一化疗剂量团结细胞因子的低剂量化疗并取得优异疗效,并通过精准基因组医学研究手艺及战略,证实低剂量化疗新计划能够有用扫除肿瘤突变(即肿瘤细胞)(Natl Sci Rev,2019)。在卫健委支持下启动低剂量化疗大规模随机比照多中心临床试验(包括天下十二家三级医院与北京基因组所)。使用单细胞转录组测序手艺,剖析了胰腺癌肿瘤-微情形高度异质性特征,展现了肿瘤亚群细胞与浸润免疫细胞间相互关系,提出了新的潜在治疗靶点,为胰腺癌精准诊治提供了新的研究偏向(Cell Res, 2019a; 封面故事)。使用CNA开发了用于泌尿上皮癌检测的集因素类决议系统(UCdetector),强调了尿液cfDNA CNA谱在无创UC检测及监测中的潜在应用价值(Clin Chem 2019, accepted);开发了一种基于尿沉渣DNA的泌尿生殖系统肿瘤诊断和定位的液体活检手艺,建设了一个有用展望尿路上皮癌和肾癌患者的预后危害评估模子(Eur Urol, 2019, accepted)。
2.发育、朽迈和疾病的基因组与表观基因组特征
发明新m6A团结卵白Prrc2a以m6A依赖的方法调控Olig2 mRNA的稳固性,在少突胶质细胞的特化和髓鞘化中施展着要害作用(Cell Res, 2019b);找到老药—恩他卡朋作为潜在的FTO抑制剂,有治疗肥胖症、糖尿病等代谢综合征的临床应用潜力(Sci Transl Med, 2019);发明m5C通详尽胞质内新团结卵白YBX1调控mRNA的稳固性,进而调控膀胱癌的增殖和转移(Nat Cell Biol, 2019);在斑马鱼胚胎发育中,发明m5C通过Ybx1调控母源mRNA的稳固性,进而调控斑马鱼母源-合子转换 及早期胚胎发育历程(Mol Cell, 2019);开发了单碱基区分率的m7G高通量测序手艺,通过该要领系统性描绘m7G在真核生物mRNA内部的漫衍特征,并进一步剖析应激处置惩罚下该修饰对卵白质翻译的分子调控机制(Cell Res, 2019c)。发明RNA m6A团结卵白Y THDF1调控树突状细胞抗原提呈能力,影响T细胞抗肿瘤免疫功效(Nature ,2019)。发明m6A能稳固R-loop的形成,进而调控基因转录的有用终止(Cell Res ,2019d)。张维绮研究组及其相助团队发明恒久低剂量的槲皮素灌胃给药处置惩罚,可以增强心理性朽迈小鼠康健寿命(Protein Cell, 2019)。
3.大数据剖析运算和精准医学范式建设
在院重点安排项目“中国人群的精准医学研究”妄想2018年深入剖析千例基因组和发放遗传报告的基础上,多个课题组继续深入剖析基因组和表型数据,进一步完成中科院人群行列的基线数据剖析,特殊是代谢性疾病相关研究,并同研究所大数据中心相助,将CASPMI第一阶段数据整理成文作为封面文章揭晓在GPB期刊上(GPB, 2019)。首次开发了能够同时剖析多个物种或群体的群体基因组数据的要领HDMKPRF,对现代人、黑猩猩、大猩猩和猩猩四个灵长类物种基因组数据做了剖析,在各个物种中判断了受到自然选择而快速进化的基因。该剖析提供了灵长类四类大猿基因进化在时间轴和基因组上的自然选择图谱。其中人类特异性快速进化的基由于后续剖析现代人群体质人类学表型和遗传性疾病的遗传机制提供了基。∕ol Biol Evol, 2019)。通过多方国际相助及其与公安部物证判断中心相助,在人群的形态特征遗传基础和法医学的DNA画像方面取得多方面主要希望,包括确定了多个影响人类面部形态的基因(eLIFE, 2019; Hum Genet, 2019);对身高遗传异质性的研究更新和优化展望模子,为东亚人群中身高的法医遗传学研究涤讪了基。↖nt J Legal Med, 2019);为构建优化人类面部的展望模子涤讪了基;基于大样本的全基因组关联剖析首次展现了人类眉毛颜色的遗传基。↗ Inv Dermatol, 2019);通过甲基化位点举行法医年岁展望模子的构建与验证(Forensic Sci Int Genet, 2019)。
4.线粒体基因组稳固性研究
发明去泛素化酶USP33在调控线粒体自噬机制方面的新机制,为剖析线粒体自噬爆发的分子机制和生物学功效提供了主要依据,为相关神经性疾病的防治提供了新的靶点(Autophagy, 2019)。发明Miro 2通过感知受损线粒体的去极化和钙释放来介导Parkin易位的主要作用,以确保线粒体自噬的准确性(Sci Bull, 2019, 封面文章)。
六、获奖及声誉
韩鼎力大举,2019年优异青年基金
杨运桂,入选科技部发育编程及其代谢调理重点专项总体专家组成员
杨运桂,入选2018年度享受国务院政府特殊津贴职员名单
杨运桂,第十二届谈家桢生命科学立异奖
杨运桂,九游会j9优异导师奖
陈艾莉,入选中科院青促会会员
赵石磊、陈传远,国家奖学金
陈传远,地奥奖学金
陈宇晟,北京市优异结业生、九游会j9大学优异结业生
杨 鑫,九游会j9优异博士论文
李 昂、赵石磊,九游会j9院长优异奖